در سایت رسمی آیت الله خامنه ای آمده است که او با تبریک هفتهی دولت، یاد شهیدان رجایی و باهنر را بهعنوان «الگوی اخلاص، پرکاری و مردمی بودن» گرامی داشته و با اشاره به «برخی تلاشها برای تطهیر منافقان روسیاه که عامل این جنایت بودند»، افزود:« متأسفانه برخی تلاش دارند تا برای این جنایتکارانی که هزاران نفر از مردم عادی تا مسئولان و شخصیتهای برجسته را به شهادت رساندند، فضای مظلومیت ایجاد و چهرهی نورانی امام راحل را خدشهدار کنند اما این دستهای خبیث و مغرض به نتیجه نخواهند رسید و همانند گذشته ناکام خواهند ماند.»
آیتالله منتظری پس از اطلاع از اعدام های ۶۷ و در جهت توقف آن، علاوه بر نگارش دو نامه به آیت الله خمینی، در تاریخ ۲۴ مرداد ۱۳۶۷ دیداری با آقایان: نیری (حاکم شرع)، اشراقی (دادستان)، رئیسی (معاون دادستان) و پورمحمدی (نماینده اطلاعات در اوین) داشتند .
۱۹ مرداد ۱۳۹۵، فایل صوتی این دیدار با رعایت امانت و بدون هیچ ویرایشی «برای اولین بار» به نقل از کانال تلگرامی آیت الله منتظری در «زیتون» نیز منتشر شد. زیتون گزارش داد که فایل مذکور پس از تماس اداره اطلاعات قم با احمد منتظری از کانال مذکور حذف شد.
انتشار این فایل صوتی با واکنش های وسیعی مواجه شد.
زیتون-احمد فعال: یادداشتی را یکی از دوستان لطف کردند و از کانال نقدآگین با عنوان…
مقدمه: گسست میان نص قانون و وجدان جمعییکی از بنیادیترین کارکردهای نظام حقوقی در…
نوشتاری با عنوان «تأملی بر فرصت نهفته در آینده ایران؛ برخاستن از خاکستر بحرانها در…
تجربه دینی چیست؟ در ترازوی نقد ۱ —طرح مسئله پرسش از ماهیت آگاهی، جایگاه انسان…
اخیرا مقاله ای در چهار بخش با عنوان " انحطاط روشنفکری دینی در ایران معاصر"…