زیتون- ساعت ۱۰ صبح روز جمعه ۱۶ بهمن ۱۳۹۴، محمد ملکی و محمد نوری زاد توسط ماموران امنیتی – اطلاعاتی جمهوری اسلامی در چهار راه پارک وی تهران بازداشت شدند. آنها طبق قراری که قبلا بطور عمومی و علنی اعلام کرده بودند، برای حرکت زیست محیطی – مدنی جمع آوری زباله در این محل حضور داشتند و منتظر حضور دیگر همراهان بودند که توسط یک ماشین پژو بازداشت شدند.
محمد ملکی، اولین رییس دانشگاه تهران بعد از انقلاب، در جریان بازداشت مجروح شد.
بر اساس اعلام صفحه رسمی دکتر ملکی در فیس بوک، ماموران امنیتی – اطلاعاتی سپس آنها را به سمت بهشت زهرا برده و در جایی پرت در بیابانهای اطراف پیاده کردند تا به خانه برگردند. تا این لحظه حال عمومی دکتر ملکی مساعد بوده اما او دچار سردرد و کوفتگی شدید بدن است.